Doktorand i medicinsk vetenskap hos BKV i Linköping

Dina arbetsuppgifter

Behandlingsresistens är den främsta orsaken till återfall vid många former av leukemi och utgör ett betydande hinder för långsiktig bot. Resistensen kan vara primär, där cellerna redan från diagnos är okänsliga för behandling, eller förvärvad, där resistenta cellkloner selekteras fram under behandlingens gång. De biologiska mekanismerna bakom behandlingsresistens är komplexa och till stor del fortfarande okända i många leukemiformer. En djupare förståelse av de molekylära och cellulära processer som driver resistens är därför avgörande för utvecklingen av mer effektiva behandlingsstrategier, biomarkörer för riskstratifiering samt individualiserade terapier som kan förbättra patienternas överlevnad och livskvalitet. För att förstå hur behandlingsresistens uppkommer och förändras över tid i olika patienter och mellan cellpopulationer studerar vi detta med hjälp av avancerad single-cell genomik med beräkningsbiologi.

Vi söker en mycket motiverad person med passion för att driva forskningsutvecklingen framåt. Den ideala kandidaten har en gedigen bakgrund inom dataanalys, utmärkt problemlösningsförmåga och trivs i en kollaborativ och tvärvetenskaplig miljö.

Som doktorand ägnar du dig åt din forskarutbildning och forskningsprojekt där du ingår. En vanlig arbetsdag kan innebära att skriva och köra kod för att behandla sekvenseringsdata på en datorserver, tillämpa statistiska modeller och maskininlärningsalgoritmer och utföra nedströms dataanalys, inklusive statistik och visualisering, samt att skriva vetenskapliga texter som summerar resultaten. I ditt arbete kan även ingå att undervisa eller att delta i andra institutionsuppdrag, upp till 20 procent av heltid.

Dina kvalifikationer

Du har avlagt examen på avancerad nivå inom Medicinsk Bioteknik eller slutfört kurser om minst 240 högskolepoäng varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inom bioinformatik eller matematisk modellering eller på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Du ska vara skicklig på både muntlig och skriftlig kommunikation på engelska och ha god samarbetsförmåga.

Dokumenterad erfarenhet av Unix command-line interfeace (CLI) och Bash kodning samt färdigheter i ett annat programmeringsspråk som Python eller R för analys och visualisering av single-cell RNA-sekvensering är ett krav. Kunskaper inom statistik, AI/ML, matematisk modellering är mycket meriterande. Kunskap inom AML och behandlingsresistens samt djupinlärningsmodeller såsom scVI är ytterligare meriterande.

Personliga egenskaper, såsom kreativitet, nyfikenhet, noggrannhet och ett strukturerat tillvägagångssätt för problemlösning är väsentliga.

Om anställningen

I samband med att du antas till forskarutbildningen handläggs din anställning som doktorand. Läs mer om respektive fakultets forskarutbildning https://liu.se/forskning/forskarutbildning

Anställningen är tidsbegränsad till normalt fyra år heltid. Du anställs till en början på ett år, och därefter förnyas anställningen med högst två år i taget, utifrån uppnådd studieplan. Förlängning av anställning upp till fem år sker utifrån grad av undervisnings- och institutionsuppdrag. Vid särskilda skäl kan ytterligare förlängning ske.

Tillträde enligt överenskommelse.

Fackliga kontaktpersoner

Information om fackliga kontaktpersoner, se https://liu.se/jobba-pa-liu/hjalp-for-sokande.